Köln im Jahr 2000. Dr Brügger untersucht den Tod eines Obdachlosen. Pest! Seuchenexperte Dr Lindenthal bestätigt die Diagnose: Der schwarze Tod ist zurück. Gemeinsam finden die Männer heraus, dass Berge toter Ratten die Wasserfilter der Kanalisation verstopfen. Nahm hier die Seuche ihren Anfang? Eine verheerende Apedemie droht der Stadt. Dessen ungeachtet verhängt die Oberbürgermeisterin Nachrichtensperre...

Köln im Ausnahmezustand. Das Militär hat die Stadt hermetisch abgeriegelt. Erkrankte stehen unter Quarantäne. Auf Flüchtende wird scharf geschossen. Große Hoffnung setzen Verena Franke, Dr. Lindenthal und der infizierte Dr Brügger auf ein Antibiotikum aus den USA. Unter der Bevölkerung breitet sich ungebremste Wut aus. Eine Gruppe, angeführt vn Pater Tankred, plant gar den Ausbruch aus der Schutzzone.